Con la altura que le vas a dar de 50 cm, le pondría unos separadores de 40 cm para que te permita darle paso por abajo y cerrar arriba (porque no vas a llenar el sump hasta el borde ¿no?) y cerrar abajo y dejar suficiente paso por arriba.
Como supongo que todas las cargas filtrantes irán en cestas, bolsas de naranjas

o rejillas para facilitar su limpieza no creo que tengas problema de que el paso sea demasiado grande. pero si las pones sobre carriles o canales en U las puedes ir ajustando según vayas viendo el rendimiento